168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1104 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  80.82 
 
 		 441 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 437 aa  871    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.52 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  60.8 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  55.9 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.31 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  52.85 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  52.39 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  52.62 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  52.62 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  52.85 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  50.8 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  53.3 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  53.3 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  53.08 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  51.14 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  52.05 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  52.44 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  52.06 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  53.18 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  46.65 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.67 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  44.65 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  44.13 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  45.74 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  45.91 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  43.08 
 
 		 431 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  45.78 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  44.06 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.47 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  42.73 
 
 		 413 aa  315  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  41.95 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  41.74 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  42.72 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  40.83 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.94 
 
 		 1140 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  33.48 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  34.52 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.94 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  35.12 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  32.96 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.41 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.11 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  34.77 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35.22 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.09 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.34 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.33 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  34.76 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  34.76 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.03 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.48 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  35.48 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  34.15 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  31.55 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  34.26 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  34.16 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  35.7 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.7 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.56 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.73 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  35.07 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  35.22 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  33.33 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.43 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.65 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.11 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.39 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  30.7 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.24 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  27.71 
 
 		 433 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.92 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  28.33 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  29.84 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  28.67 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  30.16 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.94 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  29.8 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 438 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.22 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  29.66 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  29.66 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.22 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>