168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3606 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  100 
 
 		 425 aa  842    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  36.64 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  34.72 
 
 		 415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.26 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 431 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.96 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.96 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.96 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.96 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.96 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.87 
 
 		 431 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  32.57 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.99 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  35.99 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.44 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.76 
 
 		 423 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.56 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  33.41 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  34.4 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.74 
 
 		 415 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  34.56 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  34.27 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.88 
 
 		 421 aa  225  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.56 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  31.62 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  32.85 
 
 		 389 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  32.96 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.62 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  33.5 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  33.66 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.56 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.13 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.58 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.84 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  30.04 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.96 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  31.57 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  30.59 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.7 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.38 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.1 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.72 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.61 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  30.02 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  29.61 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  31.31 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.86 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.85 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  28.38 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.79 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30.07 
 
 		 431 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  29.62 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  28.06 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  28.67 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  30.75 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  30.82 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  30.82 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  25.63 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  30.82 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  28.02 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  31.65 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  29.8 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  29.98 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  29.84 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  30.59 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  28.61 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  30.57 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  27.92 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.57 
 
 		 441 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  29.57 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.57 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  26.54 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  29.33 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  27.96 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.78 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  28.21 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.71 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  28.1 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.71 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  30.59 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  28.1 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  28.1 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.71 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.71 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  28.1 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.71 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  30.02 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.33 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>