171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1215 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  78.57 
 
 		 433 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 435 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  83.8 
 
 		 433 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  85.88 
 
 		 432 aa  731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  85.88 
 
 		 432 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 432 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  85.65 
 
 		 432 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  85.19 
 
 		 432 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  90.67 
 
 		 418 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  84.72 
 
 		 432 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  85.42 
 
 		 432 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 434 aa  858    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  85.19 
 
 		 432 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  94.47 
 
 		 435 aa  818    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.48 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  52.44 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.45 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  51.98 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  49.22 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  50.12 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 452 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  37.93 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  37.1 
 
 		 444 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  38.11 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  38.13 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  38.26 
 
 		 429 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  39.02 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  38.46 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  39.46 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  39.23 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  41.11 
 
 		 430 aa  280  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  39.5 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  38.68 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  39.54 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  35.52 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  39.77 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.03 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.88 
 
 		 1140 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.72 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.25 
 
 		 436 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  32.42 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  29.82 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.57 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  31.44 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.18 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.11 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  29.57 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.88 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.69 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  30.48 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.88 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  31.82 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  29.53 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.33 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.16 
 
 		 431 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.21 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  30.68 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  31.25 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.17 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  29.31 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  29.89 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.4 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  31.38 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.95 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  30.84 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.8 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.79 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.25 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.98 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 468 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.48 
 
 		 403 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  29.38 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.91 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.26 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.04 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.95 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  31.4 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  28.71 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  27.82 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  26.65 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  28.37 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.75 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  26.91 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  29.05 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  25.81 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.81 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>