176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3110 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  76.04 
 
 		 433 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  93.75 
 
 		 435 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  84.72 
 
 		 433 aa  736    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  99.54 
 
 		 432 aa  854    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  99.54 
 
 		 432 aa  854    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 432 aa  858    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  92.36 
 
 		 432 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  85.19 
 
 		 435 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  88.52 
 
 		 418 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  91.67 
 
 		 432 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  92.13 
 
 		 432 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  91.9 
 
 		 432 aa  799    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  85.65 
 
 		 434 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  91.9 
 
 		 432 aa  795    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  53.08 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.33 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.54 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50.58 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  48.99 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  49.76 
 
 		 426 aa  398  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  38.96 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  39.67 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  40.95 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  40.52 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  39.54 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  39.6 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  41.55 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  40.32 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  39.72 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  39.86 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  41.65 
 
 		 430 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41.74 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  40.33 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  41.51 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  36.45 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.1 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.48 
 
 		 1140 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  31.57 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  32.49 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  34.13 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  34.05 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  34.05 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  34.05 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  34.05 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  34.62 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.04 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  31.98 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  30.25 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.57 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.28 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34.06 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.29 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.69 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.62 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  35.49 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  35.13 
 
 		 410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.78 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 431 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.69 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.74 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.03 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.34 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.23 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  32.33 
 
 		 403 aa  163  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.77 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.5 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  33.62 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.73 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.29 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.59 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.09 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  28.89 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.02 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.86 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.11 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.1 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  34.2 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.56 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.61 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  28.95 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  30.02 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  27.54 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  25.92 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.4 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  27.93 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.4 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.4 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>