195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1148 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  80.05 
 
 		 431 aa  666    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  75.12 
 
 		 435 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  80.28 
 
 		 431 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 428 aa  851    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  80.05 
 
 		 431 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  77.19 
 
 		 435 aa  617  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  66.67 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  66.67 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  66.67 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  66.67 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  66.91 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  66.59 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  66.59 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  65.96 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  65.23 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  65.8 
 
 		 421 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  66.34 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  65.77 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  63.25 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  62.56 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  62.04 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  65.48 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  61.88 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  60.05 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  56.47 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  58.51 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  55.67 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  52.45 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  51.28 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  53.68 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  52.84 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  50.36 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  52.1 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  51.44 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  51.44 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  49.63 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  47.16 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  45.87 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  48.64 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.52 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  43.22 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  45.54 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  44.47 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  42.23 
 
 		 471 aa  318  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  46.7 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  39.11 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  45.75 
 
 		 408 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  44.8 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  45.32 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  38.41 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  40.33 
 
 		 485 aa  282  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  40.05 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  40.87 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  39.16 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  38.26 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  38.07 
 
 		 431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  36.95 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  37.25 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  36.92 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  36.92 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  36.92 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  36.92 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  36.68 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  36.68 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  32.49 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  36.19 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  36.19 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  36.19 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  36.19 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  36.19 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  35.4 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  34.77 
 
 		 421 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  34.56 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  34.48 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  33.81 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  34.6 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  34.8 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  33.88 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  34.56 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  34.56 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  32.33 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  32.15 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  34.24 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  35.01 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  34.77 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.63 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  34.32 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  34.24 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  30.51 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  32.52 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  31.18 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  33.11 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  33.97 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  30.57 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.82 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  31.78 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.68 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>