171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1119 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  79.76 
 
 		 433 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  87.35 
 
 		 435 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  84.69 
 
 		 433 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  88.28 
 
 		 432 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  88.28 
 
 		 432 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  86.6 
 
 		 432 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  88.52 
 
 		 432 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  86.84 
 
 		 432 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 418 aa  825    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  86.84 
 
 		 432 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  86.6 
 
 		 432 aa  725    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  90.67 
 
 		 434 aa  739    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  86.84 
 
 		 432 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  90.21 
 
 		 435 aa  757    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.46 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  53.4 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.3 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  51.76 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  49.16 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  48.85 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  50.83 
 
 		 452 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  39.1 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  39.25 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  38 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  40.28 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  39.49 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  41.65 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  38.98 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  38.85 
 
 		 406 aa  282  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  39.2 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  36.92 
 
 		 431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  40.38 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  38.82 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  39.62 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  37.97 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  38.95 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  38.81 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.95 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.68 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 1140 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  30.75 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  35.51 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35.27 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35.27 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35.27 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35.27 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  31.12 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  35.01 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.64 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.14 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  31.83 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  35.59 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.59 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.34 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.52 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.05 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  34.55 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  35.75 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.33 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.77 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.66 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  32.22 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.35 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.11 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.12 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.36 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31.48 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  31.58 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.73 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.92 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.76 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.82 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.86 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  31.22 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.6 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.1 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  32.12 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  28.88 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.23 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.54 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.95 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.45 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  29.55 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  28.29 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.76 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  27.03 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.02 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  25.48 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  27.08 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  26.64 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>