176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2125 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 468 aa  918    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  47.87 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  47.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  43.97 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  44.23 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  44.54 
 
 		 415 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  44.4 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  43.72 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  41.87 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  41.87 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  41.87 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  41.87 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  41.87 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  42.45 
 
 		 407 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  40.64 
 
 		 435 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  42.31 
 
 		 423 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  42.43 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  42.22 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  42.79 
 
 		 420 aa  342  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  42.37 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  41.74 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  42.15 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  42.7 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  41.61 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  42.36 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  42.19 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  41.34 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  41.92 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  43.32 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 		 431 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  42.98 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  43.74 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  41.39 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  39.75 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  39.96 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  41.68 
 
 		 415 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  42.7 
 
 		 412 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  42.48 
 
 		 413 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  38.94 
 
 		 428 aa  294  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  39.75 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  37.83 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  40.09 
 
 		 403 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  39.34 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  38.02 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  38.03 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6561  putative transmembrane transporter  33.63 
 
 		 556 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  36.87 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  36.69 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  36.13 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  33.97 
 
 		 413 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  36.06 
 
 		 408 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  35.84 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  36.38 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  34.04 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  32.2 
 
 		 432 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  33.26 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.05 
 
 		 431 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  38.05 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  32.2 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  32.58 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  31.83 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.31 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  30.31 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  30.31 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  30.31 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  30.31 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  31.95 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  31.66 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  32.89 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  29.4 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  29.94 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  31.42 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  29.94 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  29.94 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  29.93 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  28.91 
 
 		 412 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  30.06 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  29.31 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  30.11 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  29.98 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  31.42 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  27.67 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.63 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  29.39 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  30.62 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  29.41 
 
 		 413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  32.62 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 426 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>