175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1486 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 439 aa  872    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  52.28 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  42.11 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  42.01 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  42.99 
 
 		 415 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  43.17 
 
 		 415 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  42.15 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  38.5 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  40.73 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  40.5 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  41.67 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  42 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  40.5 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  40.5 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  40.5 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  39.64 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  41.76 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  39.77 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  42.23 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  41.61 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  40.65 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  40.84 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  40.19 
 
 		 431 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  40.32 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  39.91 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  39.95 
 
 		 431 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  39.82 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  40.37 
 
 		 420 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  38.99 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  35.54 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  37.39 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  37.74 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  35.31 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  39.54 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  38.62 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  39.73 
 
 		 403 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  38.43 
 
 		 427 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  38.58 
 
 		 413 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  36.82 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  38.5 
 
 		 429 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  37.59 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  35.24 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.18 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  38.92 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  34.24 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.63 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  35.44 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  33.87 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  35.83 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  30.66 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.18 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  32.26 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  33.2 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.27 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30.84 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  32.02 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  32.74 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  31.65 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  29.81 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  28.64 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  31.02 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  28.11 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  28.11 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.15 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  27.65 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  27.87 
 
 		 412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.03 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.86 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.86 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.86 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.86 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  29.71 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  28.64 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  28.64 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  28.93 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  27.96 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.7 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  27.42 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  30.2 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  25.4 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  28.07 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  29.45 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  28.28 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  28.28 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  29.15 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  27 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  26.87 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  26.73 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  26.76 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  25.17 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>