173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1420 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  931    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  34.17 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  35.83 
 
 		 435 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  34.14 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  35 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  34.77 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  33.99 
 
 		 428 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.28 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  34.35 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  34.05 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  34.57 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  34.57 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.25 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  34.87 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.71 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  33.79 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  33.79 
 
 		 423 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 423 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  35.08 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.82 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.69 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  35.85 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  35.32 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.77 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  35.85 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  34.84 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  34.62 
 
 		 415 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  34.99 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.32 
 
 		 421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.89 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.85 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.8 
 
 		 426 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  31.7 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.91 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.93 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  33.72 
 
 		 403 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  29.79 
 
 		 417 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  34.65 
 
 		 431 aa  166  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  31.58 
 
 		 411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.18 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  31.71 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  27.35 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.56 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.24 
 
 		 436 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  29.31 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  27.07 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  28.9 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.71 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  28.38 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.84 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  32.07 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  27.31 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  27.27 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  27.27 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  27.27 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  27.27 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  31.99 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  31.36 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.09 
 
 		 417 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  27.05 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  27.54 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  28.16 
 
 		 434 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  24.78 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  31.01 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.87 
 
 		 412 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  25.05 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  26.79 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  27.43 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  27.07 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  27.69 
 
 		 418 aa  123  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  27.29 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  24.94 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  28.67 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  26.89 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  28.47 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  26.88 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  25.4 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  23.44 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  25.45 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  27 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  26.27 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.55 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  28.22 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  26.48 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  25.05 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  25.23 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>