217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3368 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  100 
 
 		 413 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  89.59 
 
 		 412 aa  736    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  74.51 
 
 		 414 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  74.31 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  59.26 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  41.79 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  39.19 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  40.05 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  38.39 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  37.56 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  37.38 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  37.2 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  37.47 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  35.21 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  36.98 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  36.47 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  36.47 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  36.47 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  36.47 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  36.21 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  36.23 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  36.23 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  35.99 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  35.99 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  35.99 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  35.99 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  35.99 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  37.33 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  36.45 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  36.21 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  34.58 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  32.99 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.83 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.33 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  34.33 
 
 		 423 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 		 424 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.91 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  34.33 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.44 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  33.64 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.58 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.52 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.84 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  30.77 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  32.89 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.02 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.47 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.43 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.25 
 
 		 421 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  31.77 
 
 		 427 aa  215  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  34.6 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  35.64 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  31 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  31.24 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  35.28 
 
 		 434 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  35.82 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.41 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  34.85 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.18 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  28.96 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.45 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  29.91 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 468 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  30.92 
 
 		 431 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  29.95 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  30.12 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  30.12 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  30.42 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.8 
 
 		 440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  30.68 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  29.86 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  32.13 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.43 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  32.71 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.63 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  30.56 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.65 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1833  L-fucose transporter  28.26 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  30.02 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  30.73 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  30.13 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.11 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  27.93 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  30.45 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  30.21 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  31.19 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  29.85 
 
 		 405 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  29.41 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  28.78 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  27.2 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  28.74 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>