162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58479 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  100 
 
 		 372 aa  759    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  43.35 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  40.38 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04378  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06630)  36.89 
 
 		 885 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580996  normal  0.307389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  33.52 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00510  L-fucose permease, putative  31.53 
 
 		 929 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  31.55 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  33.71 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  32.71 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  32.52 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  32.95 
 
 		 414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.66 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  31.99 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  33.98 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.45 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  31.04 
 
 		 431 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.52 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  31.38 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  28.83 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  30.11 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  28.39 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  30.16 
 
 		 423 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  29.06 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  29.18 
 
 		 428 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  29.97 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  29.21 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  28.95 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  29.33 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.46 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.57 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  29.16 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.84 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  28.08 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  28.08 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.87 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  28.08 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  28.08 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  29.15 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  28.08 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.4 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  29.71 
 
 		 415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  29.71 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  28.24 
 
 		 437 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  31.34 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  28.75 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  31.06 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  29.41 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  28.46 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.78 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  27.34 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  27.34 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.32 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.31 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.47 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  29.12 
 
 		 428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  26.9 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.94 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  27.99 
 
 		 436 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  27.58 
 
 		 457 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  27.88 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  27.72 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  26.96 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  28.8 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  27.57 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  27.63 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  29.89 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  25.87 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  28.73 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  26.6 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  25.99 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  24.18 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  25.67 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.91 
 
 		 431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  27.6 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  25.48 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  24.94 
 
 		 485 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.91 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.91 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.25 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  28.17 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  26.28 
 
 		 474 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.45 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  25.77 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.17 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  24.56 
 
 		 448 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  26.33 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  27.27 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  27.27 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  27.27 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>