165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2311 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 471 aa  939    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  48.65 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  47.88 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  46.41 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  47.2 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  43.06 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  44.11 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  43.49 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  41.96 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  41.96 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  41.96 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  41.96 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  41.75 
 
 		 423 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  42.71 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  43.43 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  43.12 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  42.92 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  44.64 
 
 		 420 aa  348  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  40.49 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  43.53 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  42.71 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  42.25 
 
 		 425 aa  329  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  42.95 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  41.48 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  42.95 
 
 		 389 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  41.53 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  41.53 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  42.33 
 
 		 437 aa  322  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  41.31 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  44.64 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  41.3 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  40.72 
 
 		 426 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  40.72 
 
 		 426 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  42.05 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  42.08 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  37.97 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  42.41 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  39.74 
 
 		 403 aa  302  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  43.07 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  39.34 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  36.93 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  42.77 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  38.59 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  37.02 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  38.2 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  37.26 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  35.84 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  35.05 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  35.79 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  37.07 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.9 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.83 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.68 
 
 		 431 aa  230  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  37.23 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  37.02 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  33.69 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 488 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.7 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  36.27 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6561  putative transmembrane transporter  30.96 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  29.5 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  29.5 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  29.5 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  29.5 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  29.46 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  29.46 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  29.46 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  29.46 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  29.25 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  31.59 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.41 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  31.32 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  31.35 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.72 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  29.47 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  29.41 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  29.96 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  28.85 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  33.2 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  28.42 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  29.33 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  30.13 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  28.84 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  29.27 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  29.36 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  28.28 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  30.78 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  27.81 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  28.69 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  28.69 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  30.63 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  28.27 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  28.37 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  27.39 
 
 		 431 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  28.02 
 
 		 408 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  30.49 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  28.73 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>