174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0773 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  100 
 
 		 485 aa  963    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  48.65 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  47.87 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  41.41 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  40.12 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  48.22 
 
 		 424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  38.62 
 
 		 436 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  39.71 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  47.91 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  39.2 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  39.29 
 
 		 431 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  49.15 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  48.38 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  51.69 
 
 		 407 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  48.26 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  48.86 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  48.86 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  48.82 
 
 		 415 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  46.27 
 
 		 435 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  37.15 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  47.91 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  35.03 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  43.87 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  32.6 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  47.59 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  47.91 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  37.29 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  47.3 
 
 		 423 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  47.85 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  47.3 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  47.3 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  46.37 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  46.08 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  34.74 
 
 		 413 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  47.42 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  47.4 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  44.41 
 
 		 435 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  45.99 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  42.48 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  42.48 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.67 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  41.91 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  36.68 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6561  putative transmembrane transporter  28.74 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  48.39 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  48.03 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  31.55 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  29.92 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.44 
 
 		 417 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  38.11 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.04 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  29.29 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  31.19 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  41.64 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  30.1 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  29.49 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  29.63 
 
 		 425 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  41.31 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  39.4 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  30.85 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  30.85 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.78 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  29.03 
 
 		 399 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  41.32 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  28.87 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  30.64 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  31.08 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  28.98 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 412 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  30.77 
 
 		 417 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  27.08 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  30.91 
 
 		 411 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  30.14 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  29.76 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  34.58 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.52 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  28.05 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  28.6 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  29.23 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  27.98 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  29.74 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  28.78 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>