220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0644 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  100 
 
 		 409 aa  829    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  47.33 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  51.14 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  45.41 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  47.94 
 
 		 418 aa  354  1e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  47.42 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  47.88 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  44.03 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  43.98 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  43.96 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  43.73 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  43.96 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  44.06 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  41.79 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  38.72 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  42.99 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  39.11 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  39.91 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  38.77 
 
 		 438 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  38.86 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  38.86 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  38.86 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  38.86 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  38.04 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  38.04 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  38.04 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  38.04 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  38.61 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  37.8 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  36.1 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  36.1 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  36.1 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  36.1 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  38.35 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  35.85 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  35.49 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  39.07 
 
 		 415 aa  265  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  36.59 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  39.07 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  36.59 
 
 		 423 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  36.34 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  40.05 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  38.16 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  38.13 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  39.75 
 
 		 468 aa  259  7e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  36.1 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  36.57 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  38.7 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  36.69 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  38.73 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  37.63 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  36.79 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  37.4 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  36.98 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  37.66 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  36.66 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  36.66 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  36.16 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  36.98 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  35.7 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  36.08 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  35.71 
 
 		 428 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  34.94 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  36.95 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  35.55 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  34.26 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  35.61 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  35.18 
 
 		 448 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  37.59 
 
 		 436 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  34.77 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  32.49 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  34.31 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  34.69 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  34.47 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  35.35 
 
 		 457 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  35.35 
 
 		 457 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  36.01 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  37.13 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  35.52 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  36.41 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  36.08 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  33.69 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  33.41 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  35.82 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  31.55 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  31.74 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  33.64 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  33.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  33.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  33.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  33.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  33.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  34.62 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  33.52 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  32.12 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  32.39 
 
 		 412 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  32.48 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  31.74 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  29.95 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>