182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0406 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  100 
 
 		 451 aa  925    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  68.1 
 
 		 448 aa  634  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  53.16 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  51.28 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  51.28 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  51.28 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  51.28 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  51.28 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  46.37 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  48.33 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  47.61 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  46.33 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  47.61 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  33.95 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  33.57 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  34.71 
 
 		 411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  31.88 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  32.61 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  32.09 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.19 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.86 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  31.85 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  32.4 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  30.38 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  33.87 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  29.95 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  31.34 
 
 		 474 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.09 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  29.8 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.55 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.33 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  30.24 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  29.27 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  28.54 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.51 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.51 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  28.78 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  28.89 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  29.71 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  29.81 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.38 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  29.79 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  28.74 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.6 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  28.71 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  25.71 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  26.57 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  28.36 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  27.82 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  26.59 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  27.96 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  28.44 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  29.03 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  27.5 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  27.71 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  25.59 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  29.52 
 
 		 389 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.89 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1833  L-fucose transporter  27.77 
 
 		 644 aa  160  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  27.91 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  27.5 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.94 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  27.25 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.94 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  26.91 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  26.72 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  28.54 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  25.22 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  25.11 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  30.02 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.9 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.78 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  27.29 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  25.74 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  24.94 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  26.68 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  27.79 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  25.76 
 
 		 431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  24.66 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  25.32 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  25.77 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>