190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1789 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  84.1 
 
 		 415 aa  684    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  77.09 
 
 		 424 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  80.14 
 
 		 423 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  79.67 
 
 		 423 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  79.91 
 
 		 423 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 421 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  81.32 
 
 		 423 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  79.67 
 
 		 423 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  79.67 
 
 		 423 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  80.29 
 
 		 421 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  79.67 
 
 		 423 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  79.67 
 
 		 423 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  70.31 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  72.89 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  65.38 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  65.14 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  64.65 
 
 		 435 aa  524  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  65.38 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  63.12 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  62.68 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  65.8 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  66.01 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  63.37 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  62.82 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  60.87 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  55.94 
 
 		 435 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  58.38 
 
 		 389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  55.24 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  56.02 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  52.94 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  52.27 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  53.98 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  52.53 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  50.62 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  53.98 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  52.45 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  51.16 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  48.22 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  44.59 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  43.43 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  42.27 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  47.86 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  43.8 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  44.91 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  45.61 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  40.74 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  46.38 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  48.74 
 
 		 431 aa  309  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  41.42 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  39.43 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  46.02 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  45.76 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  39.02 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  40.72 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  38.3 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  38.94 
 
 		 431 aa  273  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  38.14 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  36.88 
 
 		 409 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  37.59 
 
 		 431 aa  252  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  35.32 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  35.24 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  34.4 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  37.68 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  35.73 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  34.06 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  34.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  34.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  34.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  34.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  34.63 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.4 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  35.45 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  33.98 
 
 		 457 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  32.76 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  34.13 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  34.13 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  34.13 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  34.13 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  34.13 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  32.44 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  31.95 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  31.95 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  32.25 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.84 
 
 		 412 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  33.17 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  32.93 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  34.94 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  32.01 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  33.82 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  33.25 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  33.18 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 467 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  32.65 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  29.27 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  34.61 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  30.41 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  34.36 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 468 aa  193  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>