181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2428 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  100 
 
 		 433 aa  842    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  48.26 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  50.25 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  45.58 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  45.58 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  45.58 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  45.58 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  45.35 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  45.35 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  52.1 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  44.19 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  44.19 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  44.19 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  44.19 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  44.19 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  48.64 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  49.28 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  44.61 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  41.91 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  42.99 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  41.83 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  36.6 
 
 		 420 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  39.53 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  38.59 
 
 		 457 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  39.06 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  39.06 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  38.28 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  37.68 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  36.53 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  40.65 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  38.04 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  37.03 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  39.95 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  36.17 
 
 		 414 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  37.29 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  40.48 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  38.71 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  37.9 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  36.21 
 
 		 413 aa  253  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  38.16 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  37.69 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  37.44 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  39.32 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  36.93 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  33.94 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  33.11 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  35.28 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  35.28 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  35.28 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  35.28 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  35.28 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  34.41 
 
 		 474 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  33.88 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  37.71 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  32.87 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  36.19 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  35.09 
 
 		 435 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  33.82 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  33.65 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  34.24 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  33.57 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  35.24 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  34.12 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  36.32 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  35.8 
 
 		 399 aa  226  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  36.25 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  33.87 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  35.2 
 
 		 425 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.75 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  36.25 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  36 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  38.16 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  34.21 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.72 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.72 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  35.18 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 421 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  37.81 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.4 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  34.84 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  31.13 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  32.17 
 
 		 471 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  34.71 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  35.52 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  32.93 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  30.19 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  31.05 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  34.24 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  33.94 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  35.27 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  29.7 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  32.31 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  32.07 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  31.5 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>