166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1833 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1833  L-fucose transporter  100 
 
 		 644 aa  1312    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  56.35 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  41.76 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  37.07 
 
 		 430 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  38.14 
 
 		 442 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  35.59 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  37.76 
 
 		 381 aa  243  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  203  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  203  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  203  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  203  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  28.51 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  30.74 
 
 		 457 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  30 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  32.27 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.6 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  48.47 
 
 		 474 aa  184  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.95 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  28.35 
 
 		 431 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  27.48 
 
 		 409 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  28.6 
 
 		 412 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  28.26 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  26.95 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  26.15 
 
 		 418 aa  157  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  27.38 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  26.98 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  26.15 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  26.76 
 
 		 423 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  27.69 
 
 		 423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 		 435 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  25.28 
 
 		 415 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  26.35 
 
 		 429 aa  143  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  24.89 
 
 		 428 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  35.62 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  35.62 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  35.62 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  35.62 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  35.62 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  25.68 
 
 		 431 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  25.45 
 
 		 431 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  25.23 
 
 		 431 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  25.49 
 
 		 421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  24.14 
 
 		 440 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  34.98 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  25.8 
 
 		 424 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  38.15 
 
 		 414 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.47 
 
 		 417 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  38.46 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  38.46 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  38.46 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  39.58 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  38 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  36.07 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  26.35 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  26.06 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  26.06 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  41.14 
 
 		 451 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  34.72 
 
 		 417 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.34 
 
 		 424 aa  120  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.3 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  38.01 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  38.01 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  38.01 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  38.01 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  38.01 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.8 
 
 		 421 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.99 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  35.37 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  25.85 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  36.69 
 
 		 448 aa  115  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  35.9 
 
 		 410 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.02 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  32.11 
 
 		 435 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  24.51 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  33.13 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.87 
 
 		 425 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  25.26 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  24.94 
 
 		 419 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  28.18 
 
 		 428 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  24.56 
 
 		 459 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.72 
 
 		 415 aa  104  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  30.77 
 
 		 428 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  23.65 
 
 		 425 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  31.91 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  35.8 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 415 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.97 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  22.43 
 
 		 438 aa  98.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  23.79 
 
 		 441 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 		 468 aa  97.8  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  22.71 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>