74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4979 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1060 aa  2123    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 
752 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  41.55 
 
 
850 aa  95.9  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.82 
 
 
1441 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  44.72 
 
 
987 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.68 
 
 
1362 aa  89  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  39.39 
 
 
1581 aa  87.8  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.6 
 
 
1158 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.4 
 
 
578 aa  87  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.33 
 
 
756 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.21 
 
 
915 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.35 
 
 
674 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 
962 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.52 
 
 
588 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  45.95 
 
 
999 aa  79.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.77 
 
 
1564 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  47.52 
 
 
1070 aa  76.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.28 
 
 
581 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.5 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.76 
 
 
755 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.81 
 
 
722 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.74 
 
 
815 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.8 
 
 
4013 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  49.38 
 
 
1059 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  49.41 
 
 
433 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50 
 
 
1321 aa  72  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  47.67 
 
 
1103 aa  72  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  44.07 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.81 
 
 
1007 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.96 
 
 
847 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 
940 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.22 
 
 
819 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  41.3 
 
 
879 aa  68.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  44.58 
 
 
732 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.12 
 
 
984 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  47.56 
 
 
571 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.58 
 
 
929 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  47.69 
 
 
1338 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.68 
 
 
953 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.22 
 
 
1448 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  46.15 
 
 
452 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  45.24 
 
 
449 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  40.24 
 
 
392 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  42.17 
 
 
558 aa  61.6  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.86 
 
 
801 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 
1471 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.57 
 
 
1059 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  45.35 
 
 
578 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2295  hypothetical protein  25 
 
 
456 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0177107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.68 
 
 
538 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.45 
 
 
695 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.48 
 
 
722 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
1332 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.76 
 
 
971 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.26 
 
 
820 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.11 
 
 
1028 aa  55.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  39.76 
 
 
1439 aa  51.6  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.78 
 
 
795 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
1184 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
729 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.14 
 
 
471 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.97 
 
 
986 aa  47.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  32 
 
 
818 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.64 
 
 
472 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.64 
 
 
472 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.04 
 
 
1164 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.86 
 
 
1139 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2301  hypothetical protein  24.38 
 
 
457 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000171205  normal  0.0280114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  29.08 
 
 
557 aa  46.2  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.07 
 
 
929 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.38 
 
 
487 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  52.38 
 
 
487 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  34.78 
 
 
1695 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.38 
 
 
480 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>