199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0821 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  100 
 
 
558 aa  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  58.51 
 
 
732 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.47 
 
 
507 aa  157  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  30.31 
 
 
543 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  29.07 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  29.58 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  30.79 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.34 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
752 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  29.34 
 
 
523 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  31.62 
 
 
478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  28.71 
 
 
1294 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  28.71 
 
 
1414 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  30.48 
 
 
1369 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  29.77 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.8 
 
 
637 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  37.82 
 
 
1441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.2 
 
 
953 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.52 
 
 
755 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  30.62 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  40.65 
 
 
850 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  45.19 
 
 
987 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  27.93 
 
 
468 aa  114  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  44.96 
 
 
571 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  40.28 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.33 
 
 
971 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.96 
 
 
756 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  45.38 
 
 
392 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  41.73 
 
 
1070 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.35 
 
 
1007 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.09 
 
 
962 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  37.13 
 
 
999 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.98 
 
 
929 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  38.41 
 
 
1581 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.94 
 
 
1321 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.13 
 
 
674 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45 
 
 
801 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  44.93 
 
 
1059 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.59 
 
 
819 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  43.36 
 
 
578 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.52 
 
 
722 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  52.83 
 
 
452 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.35 
 
 
1158 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.63 
 
 
639 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  40.74 
 
 
449 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.79 
 
 
588 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  45.16 
 
 
1338 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 
4013 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.98 
 
 
1362 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.84 
 
 
915 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.55 
 
 
815 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  37.96 
 
 
1103 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.62 
 
 
1564 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.48 
 
 
581 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.94 
 
 
578 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.22 
 
 
790 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 
1332 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.55 
 
 
940 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.12 
 
 
984 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.45 
 
 
695 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  39.72 
 
 
1059 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  44.95 
 
 
736 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  54.55 
 
 
707 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.76 
 
 
729 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  48.05 
 
 
710 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  33.52 
 
 
1471 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.25 
 
 
842 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.95 
 
 
1117 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  37.16 
 
 
1077 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 
707 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40 
 
 
471 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.81 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  27.57 
 
 
850 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.44 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
739 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.44 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  41.96 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.96 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.33 
 
 
1051 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  41.07 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.07 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.03 
 
 
511 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.96 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  49.28 
 
 
600 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.29 
 
 
1139 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
710 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  49.33 
 
 
837 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.15 
 
 
831 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.89 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.07 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.84 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  38.68 
 
 
879 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  42.2 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.56 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.5 
 
 
948 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  47.06 
 
 
567 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.33 
 
 
533 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>