21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2541 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1723    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.23 
 
 		 507 aa  87.4  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  25.98 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  28.09 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  28.51 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.21 
 
 		 732 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  24.24 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  36.15 
 
 		 912 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.31 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  27.57 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  26.42 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  25.42 
 
 		 460 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  35.87 
 
 		 1414 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  35.87 
 
 		 1369 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  35.87 
 
 		 1294 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  25.2 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  28.12 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  25.99 
 
 		 468 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1208 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  28.81 
 
 		 600 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  21.8 
 
 		 357 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>