127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3132 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  100 
 
 
411 aa  846    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  71.88 
 
 
710 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  61.76 
 
 
789 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  60 
 
 
600 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  60.81 
 
 
630 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  56.16 
 
 
707 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  48.36 
 
 
484 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  59.42 
 
 
591 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.56 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  61.54 
 
 
599 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  64.62 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  57.75 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  48.65 
 
 
567 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
639 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 
710 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  56.06 
 
 
928 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  60.61 
 
 
1051 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
895 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  58.06 
 
 
1224 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 
773 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  56.92 
 
 
842 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  53.12 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.19 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  50.7 
 
 
814 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  53.12 
 
 
982 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 
590 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  51.43 
 
 
922 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.32 
 
 
790 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2214  SCP-like extracellular  24.19 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169966  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  56.45 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 
563 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  53.12 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  56.45 
 
 
741 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  58.06 
 
 
928 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0106  hypothetical protein  24.26 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000711412  hitchhiker  0.000000000680686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 
739 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  49.23 
 
 
707 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  47.3 
 
 
660 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
961 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 
736 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  49.3 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  51.56 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.5 
 
 
807 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 
469 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 
611 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 
1122 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  47.22 
 
 
683 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  48.48 
 
 
1077 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
649 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 
1601 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41.11 
 
 
948 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 
837 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
580 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  52.38 
 
 
533 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 
820 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  50.79 
 
 
730 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
619 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  48.44 
 
 
621 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  49.21 
 
 
571 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 
742 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  40 
 
 
900 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 
501 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  42.62 
 
 
746 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 
965 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.33 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  54.39 
 
 
528 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.15 
 
 
533 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.24 
 
 
511 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.93 
 
 
324 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  41.27 
 
 
780 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  39.68 
 
 
536 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  40.95 
 
 
848 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  33.06 
 
 
949 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.53 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  40.3 
 
 
532 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  40.3 
 
 
477 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  52.54 
 
 
526 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  48.48 
 
 
316 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  42.65 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  41.18 
 
 
435 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 
1015 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  37.14 
 
 
539 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  37.18 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
604 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  35.53 
 
 
583 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 
541 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 
535 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  37.5 
 
 
298 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  46.3 
 
 
757 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  41.54 
 
 
524 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.08 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
1209 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2271  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.83 
 
 
178 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00813708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  40.32 
 
 
725 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  43.08 
 
 
311 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  42.19 
 
 
873 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  38.1 
 
 
955 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3299  SCP-like extracellular  24.26 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000136792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  41.27 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>