186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1597 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 471 aa  974    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  57.24 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  48.81 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  51.82 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  50.13 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  47.97 
 
 		 408 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  48.92 
 
 		 567 aa  350  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  50.13 
 
 		 541 aa  346  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  49.18 
 
 		 535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  45.77 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  47.99 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  48.49 
 
 		 693 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  43.93 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  43.49 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  45.18 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  44.59 
 
 		 548 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  43.72 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  43.16 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  40.72 
 
 		 727 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  40.73 
 
 		 850 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  36.28 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  35.93 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  35.57 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  36.01 
 
 		 631 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  35.22 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  37.22 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 658 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.56 
 
 		 636 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  31.04 
 
 		 640 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  42.09 
 
 		 320 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  33.25 
 
 		 677 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.46 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  32.87 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.79 
 
 		 737 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.34 
 
 		 434 aa  180  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.95 
 
 		 589 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.7 
 
 		 583 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  31.25 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.73 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.54 
 
 		 612 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.46 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.76 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  31.42 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  27.8 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.29 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.86 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  27.48 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.83 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.4 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  23.91 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25.06 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  25.46 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  51.95 
 
 		 425 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  36.17 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  55.22 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.57 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.46 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  46.27 
 
 		 820 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  43.66 
 
 		 814 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  44.59 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.96 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  31.43 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  47.69 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.63 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  38.16 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  38.57 
 
 		 848 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  49.3 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  33.65 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.08 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  42.62 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  41.98 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  44.93 
 
 		 870 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  35.96 
 
 		 567 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  38.14 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.37 
 
 		 1051 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  41.03 
 
 		 949 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  43.94 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  47.76 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  35.06 
 
 		 955 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  23.01 
 
 		 1172 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  44.62 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  42.65 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.53 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.33 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  39.39 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.82 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  40.79 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.9 
 
 		 710 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>