274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1229 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 535 aa  1098    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  62.64 
 
 		 679 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.28 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  45.75 
 
 		 1186 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  43.58 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  41.65 
 
 		 618 aa  329  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  41.81 
 
 		 1338 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  42.3 
 
 		 712 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  39.78 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  35.78 
 
 		 667 aa  248  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  38.62 
 
 		 383 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  54.08 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  54.38 
 
 		 1015 aa  209  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  36 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  55.03 
 
 		 951 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 		 604 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  53.27 
 
 		 1122 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  54.04 
 
 		 536 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  53.03 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  40.44 
 
 		 928 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  51.49 
 
 		 780 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  52.04 
 
 		 746 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  29.62 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 		 315 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  51.6 
 
 		 965 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  48.51 
 
 		 501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 315 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 		 315 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  53.12 
 
 		 1164 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.95 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  37.57 
 
 		 317 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  38.25 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.19 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  35.62 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  37.78 
 
 		 348 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 311 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.03 
 
 		 316 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  46.35 
 
 		 629 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.12 
 
 		 383 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  34.29 
 
 		 302 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  33.53 
 
 		 326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.38 
 
 		 344 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  32.49 
 
 		 324 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.78 
 
 		 346 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.99 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.45 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.95 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.63 
 
 		 487 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 		 837 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.63 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38 
 
 		 683 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  32.15 
 
 		 644 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  38.31 
 
 		 912 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  30.57 
 
 		 323 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.68 
 
 		 320 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  30.38 
 
 		 344 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  41.34 
 
 		 630 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  30.99 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.37 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 423 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  28.73 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.74 
 
 		 344 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.46 
 
 		 1290 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  44.03 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  27.15 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.27 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  24.89 
 
 		 471 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  39.37 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  37.3 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 566 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  39.23 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  41.59 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  52.05 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  40 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.53 
 
 		 945 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  49.28 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  49.28 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.06 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  47.22 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.35 
 
 		 953 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.53 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.38 
 
 		 790 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.63 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  36.07 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  39.05 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.8 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 		 1505 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.36 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  47.95 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.93 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.66 
 
 		 842 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.08 
 
 		 884 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  45.59 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  39.74 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>