250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4176 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  83.8 
 
 		 957 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 884 aa  1810    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  49.6 
 
 		 726 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  66.82 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  50.21 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  45.93 
 
 		 1187 aa  221  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  50.67 
 
 		 536 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  64.29 
 
 		 389 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  41.23 
 
 		 465 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  36.8 
 
 		 1141 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.61 
 
 		 1132 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.62 
 
 		 610 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  56.8 
 
 		 383 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  47.1 
 
 		 569 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  48.48 
 
 		 673 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1167 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.43 
 
 		 1139 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.7 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.48 
 
 		 580 aa  108  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.23 
 
 		 393 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  48.21 
 
 		 461 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.34 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  43.28 
 
 		 705 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  25.96 
 
 		 791 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.58 
 
 		 474 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  45.9 
 
 		 982 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  42.22 
 
 		 401 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  37.09 
 
 		 1391 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  39.17 
 
 		 863 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  41.43 
 
 		 430 aa  101  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  41.13 
 
 		 877 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  37.78 
 
 		 563 aa  98.2  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  37.96 
 
 		 691 aa  98.6  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  98.6  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.59 
 
 		 396 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  54.65 
 
 		 613 aa  97.8  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  37.78 
 
 		 571 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 503 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  42.75 
 
 		 639 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.44 
 
 		 520 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  42.97 
 
 		 483 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.73 
 
 		 495 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.22 
 
 		 550 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.69 
 
 		 1259 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  38.93 
 
 		 491 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  36.3 
 
 		 569 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 436 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38 
 
 		 412 aa  90.9  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  26.55 
 
 		 566 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  48.19 
 
 		 484 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40.8 
 
 		 503 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  39.02 
 
 		 869 aa  87.4  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.35 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.57 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  41.86 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.22 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  40.62 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  48.86 
 
 		 692 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.59 
 
 		 581 aa  84  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.86 
 
 		 514 aa  84  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  32.24 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.52 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  42.98 
 
 		 918 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  39.67 
 
 		 853 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.51 
 
 		 695 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.62 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  33.08 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.28 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.98 
 
 		 933 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.82 
 
 		 507 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  44.58 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  31.35 
 
 		 802 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 845 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.62 
 
 		 823 aa  75.5  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  22.78 
 
 		 789 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.07 
 
 		 1444 aa  75.5  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.71 
 
 		 1413 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 943 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.06 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.85 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  38.83 
 
 		 819 aa  74.7  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 951 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  34.96 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  34.13 
 
 		 912 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2627  hypothetical protein  26.93 
 
 		 396 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  39.6 
 
 		 1380 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.33 
 
 		 445 aa  73.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  36.79 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  31.38 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.25 
 
 		 1356 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  36.59 
 
 		 1091 aa  72  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 870 aa  71.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.54 
 
 		 948 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.89 
 
 		 566 aa  72  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.79 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  32.17 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>