56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0531 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  78.98 
 
 		 471 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 471 aa  974    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  25.37 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  30.15 
 
 		 1186 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  25.1 
 
 		 679 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 509 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  24.41 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.78 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  23.76 
 
 		 618 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 		 344 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  26.06 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.96 
 
 		 346 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  22.98 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.08 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.64 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  24.76 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.57 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.33 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  22.6 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.93 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  26.03 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.07 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.04 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  26.52 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  24.02 
 
 		 712 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 		 1338 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  24.4 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  27.05 
 
 		 313 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  23.79 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 319 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  23.5 
 
 		 324 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  23.75 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  21.92 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  24.22 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  23.63 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.18 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  29.9 
 
 		 951 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 804 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  28.84 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  30.11 
 
 		 357 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  30.69 
 
 		 928 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 		 703 aa  43.5  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>