239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2866 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 487 aa  1004    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 		 644 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  39.07 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  39.19 
 
 		 330 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  37.96 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  40.07 
 
 		 313 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  37.71 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  38.28 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  36.27 
 
 		 323 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  36.12 
 
 		 524 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.45 
 
 		 1186 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  33.56 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 618 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  35.21 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  34.98 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  35.67 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  34.4 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.47 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  36.51 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  34.48 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 325 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  30.79 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  31.1 
 
 		 317 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.3 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  35.27 
 
 		 679 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30.28 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  34.32 
 
 		 319 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 537 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.36 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  33.76 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  33.7 
 
 		 319 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.65 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 		 330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  33.58 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.75 
 
 		 320 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  32 
 
 		 527 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.03 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.39 
 
 		 346 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  34.09 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.85 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.6 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.58 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 326 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.86 
 
 		 1338 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.94 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 855 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.8 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.14 
 
 		 335 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.72 
 
 		 341 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  27.46 
 
 		 404 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  27.43 
 
 		 344 aa  86.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  37.01 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.13 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  30.71 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.43 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  29.59 
 
 		 667 aa  80.1  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.1 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  31.64 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.16 
 
 		 712 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  36 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.43 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.56 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.42 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  24.16 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  24.65 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.99 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  31.29 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.46 
 
 		 1413 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.36 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  23.57 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.26 
 
 		 512 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.29 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.25 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 1139 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.24 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.46 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 884 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>