206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3903 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
340 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  46.56 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  49.04 
 
 
310 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  43.82 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  33.84 
 
 
315 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  33.94 
 
 
306 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  36.17 
 
 
304 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  31.68 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  32.41 
 
 
384 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
644 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30.52 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  31.58 
 
 
341 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
345 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  30.84 
 
 
713 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 
319 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 
323 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 
487 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 
324 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.8 
 
 
313 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
325 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  30.93 
 
 
344 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.74 
 
 
319 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  30.7 
 
 
330 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 
327 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
348 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  30.69 
 
 
524 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 
522 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 
472 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  32.87 
 
 
505 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  30.97 
 
 
699 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.41 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.78 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 
855 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  30.39 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.78 
 
 
540 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.37 
 
 
456 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  27.14 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  29.39 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.45 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
572 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 
535 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  33.33 
 
 
527 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.9 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.69 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.08 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
512 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
545 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  34.46 
 
 
551 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.97 
 
 
577 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  26.84 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  29.26 
 
 
560 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.52 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.96 
 
 
618 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
537 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.96 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.44 
 
 
607 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 
1338 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.16 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.16 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.83 
 
 
523 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.05 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  29.44 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 
829 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  24.84 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.25 
 
 
537 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.46 
 
 
558 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.38 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.64 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 
511 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  24.52 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  38.94 
 
 
465 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
510 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  24.16 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.57 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.19 
 
 
507 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 
497 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 
537 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 
522 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.73 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.54 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.02 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.69 
 
 
522 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>