105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5674 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  100 
 
 		 425 aa  863    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1313  hypothetical protein  54.86 
 
 		 334 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6262  protease B  50.76 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0777817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4241  hypothetical protein  37.11 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13468  hypothetical protein  35.05 
 
 		 284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 1413 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  35.65 
 
 		 491 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.18 
 
 		 1139 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 569 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  32.37 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 615 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  43.97 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.04 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.07 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.98 
 
 		 503 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  37.01 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  37.41 
 
 		 2073 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.18 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  37.04 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.88 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.74 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.62 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  35.42 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3334  hypothetical protein  26.88 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.59857  hitchhiker  0.00275482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.81 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.23 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.71 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.42 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.71 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  42.34 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.53 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.04 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.86 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  36.17 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.29 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  35.84 
 
 		 663 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.71 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  38.97 
 
 		 560 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.38 
 
 		 884 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  38.03 
 
 		 571 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  37.78 
 
 		 691 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.46 
 
 		 957 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.5 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.24 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  34.03 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.64 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6184  hypothetical protein  32.57 
 
 		 250 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.94 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  39.26 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  33.8 
 
 		 789 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.03 
 
 		 476 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.81 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  35.37 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0174  hypothetical protein  27.67 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.56 
 
 		 943 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  38.61 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  31.54 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  36.44 
 
 		 1141 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  31.17 
 
 		 664 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  32.81 
 
 		 1172 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 1259 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  31.69 
 
 		 1187 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  35.92 
 
 		 963 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 		 756 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.54 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.84 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.56 
 
 		 794 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  30.05 
 
 		 555 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 568 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  25.95 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.91 
 
 		 576 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 737 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.09 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  37.36 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.5 
 
 		 1567 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  34.04 
 
 		 479 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  26.57 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  32.5 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.64 
 
 		 644 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.3 
 
 		 933 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  24.35 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  34.23 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.54 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.63 
 
 		 516 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  28.65 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  28.19 
 
 		 948 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  34.38 
 
 		 771 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.9 
 
 		 824 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.48 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  30.71 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>