174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6866 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  100 
 
 
493 aa  997    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  60.4 
 
 
494 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  42.74 
 
 
475 aa  289  9e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.66 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  39.67 
 
 
325 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  38.73 
 
 
501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  37.24 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  33.24 
 
 
488 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  30.65 
 
 
369 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  30.73 
 
 
381 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  30.37 
 
 
1197 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  26.24 
 
 
345 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 
510 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  25.74 
 
 
1278 aa  100  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.52 
 
 
503 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  26.07 
 
 
360 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  28.87 
 
 
497 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  33.91 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  31.37 
 
 
1413 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.88 
 
 
503 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.02 
 
 
737 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.85 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.62 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.99 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.35 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  28.57 
 
 
789 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  32.84 
 
 
1139 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.61 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  41.05 
 
 
943 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  35.66 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  33.33 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  29.32 
 
 
569 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.16 
 
 
487 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.51 
 
 
672 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  33.33 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.61 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.78 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  33.33 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.19 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.97 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.89 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.37 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.29 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.08 
 
 
863 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.08 
 
 
498 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  32.48 
 
 
824 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.2 
 
 
507 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.82 
 
 
618 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.67 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.08 
 
 
2073 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  28.39 
 
 
801 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.65 
 
 
479 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  34.88 
 
 
1049 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.46 
 
 
982 aa  63.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.14 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.23 
 
 
1016 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.65 
 
 
771 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  27.97 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 
691 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.66 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  32.33 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  27.69 
 
 
1567 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.78 
 
 
466 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.21 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  43.59 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.07 
 
 
461 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.17 
 
 
1259 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 
933 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  39.06 
 
 
1347 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.12 
 
 
794 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  30.53 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.69 
 
 
507 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.79 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 
537 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.92 
 
 
1577 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  33.33 
 
 
748 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  32.19 
 
 
726 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.59 
 
 
472 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 
535 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  29.08 
 
 
547 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.59 
 
 
806 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 
806 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  24.83 
 
 
507 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  30.86 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  29.29 
 
 
1222 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.82 
 
 
803 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.3 
 
 
695 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.28 
 
 
576 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.48 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
709 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  29.68 
 
 
548 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.01 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.18 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>