205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6159 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
507 aa  1045    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.19 
 
 
340 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.48 
 
 
347 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.05 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.88 
 
 
355 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.9 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  33.4 
 
 
627 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 
634 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
634 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  41.9 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  38.95 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.98 
 
 
628 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.64 
 
 
466 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.12 
 
 
607 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.82 
 
 
353 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 
580 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  31.03 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
648 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  34.32 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  34.32 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  34.32 
 
 
316 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  34.32 
 
 
316 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33 
 
 
316 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.99 
 
 
316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  34.14 
 
 
329 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.15 
 
 
315 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  34.11 
 
 
344 aa  152  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.42 
 
 
392 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.34 
 
 
378 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  34.38 
 
 
340 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.43 
 
 
505 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.34 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.96 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.03 
 
 
362 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.49 
 
 
341 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.21 
 
 
369 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.86 
 
 
517 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.22 
 
 
315 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.44 
 
 
314 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.46 
 
 
426 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.63 
 
 
315 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 
333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 
333 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 
333 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  26.91 
 
 
2073 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  37.04 
 
 
571 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 
487 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.55 
 
 
491 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.58 
 
 
510 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  32.05 
 
 
1139 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 
1278 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.04 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  29.11 
 
 
647 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.53 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.68 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.09 
 
 
943 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.54 
 
 
476 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  30.88 
 
 
691 aa  83.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.6 
 
 
507 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  35 
 
 
576 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.07 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.07 
 
 
520 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.85 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.36 
 
 
824 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.62 
 
 
672 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.11 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  29.49 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.09 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.86 
 
 
566 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.81 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  31.82 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.81 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.17 
 
 
737 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.97 
 
 
756 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1259 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  30 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.65 
 
 
789 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.79 
 
 
884 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.78 
 
 
537 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  36.64 
 
 
425 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.86 
 
 
963 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  31.34 
 
 
897 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.5 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  33.33 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  30.88 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  30.99 
 
 
569 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 
957 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  30.19 
 
 
445 aa  67  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.78 
 
 
695 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.36 
 
 
1016 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.08 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  29.71 
 
 
411 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.8 
 
 
618 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  27.54 
 
 
230 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  27.4 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 
304 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>