145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2450 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  100 
 
 
582 aa  1151    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3897  Parallel beta-helix repeat protein  61.89 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00247458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  79.31 
 
 
537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3900  hypothetical protein  33.22 
 
 
731 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  67.13 
 
 
503 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  44.37 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  30.66 
 
 
744 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1869  parallel beta-helix repeat protein  40.12 
 
 
384 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  39.44 
 
 
560 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  59.86 
 
 
566 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08927  conserved hypothetical protein  36.94 
 
 
355 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096319 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  55.56 
 
 
510 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  49.65 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  44.44 
 
 
1413 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  42.96 
 
 
472 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  40.54 
 
 
789 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40.91 
 
 
412 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  43.61 
 
 
897 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  44.26 
 
 
771 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.15 
 
 
507 aa  97.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  42.65 
 
 
963 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40.44 
 
 
691 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  39.1 
 
 
672 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.64 
 
 
507 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.39 
 
 
491 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.13 
 
 
520 aa  94  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.71 
 
 
474 aa  93.6  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  39.47 
 
 
494 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  40 
 
 
1139 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.44 
 
 
495 aa  92  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.76 
 
 
1259 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.23 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.88 
 
 
507 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  37.86 
 
 
576 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.96 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.33 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.04 
 
 
436 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.26 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.29 
 
 
569 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  37.41 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.37 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.4 
 
 
957 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.17 
 
 
695 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.77 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.21 
 
 
737 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.78 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.42 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 
507 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  37.59 
 
 
615 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.33 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.48 
 
 
794 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  34.96 
 
 
884 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.43 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  39.13 
 
 
1187 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.33 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.57 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  39.23 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.4 
 
 
618 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.88 
 
 
863 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  34.21 
 
 
555 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.03 
 
 
982 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  40.23 
 
 
943 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  27.89 
 
 
664 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  42.86 
 
 
824 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.06 
 
 
709 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35.07 
 
 
427 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.28 
 
 
2073 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  28.15 
 
 
230 aa  60.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  40.7 
 
 
468 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.82 
 
 
801 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.38 
 
 
472 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.55 
 
 
487 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.22 
 
 
498 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.1 
 
 
647 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 
391 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 
628 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.87 
 
 
483 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.86 
 
 
493 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  34.65 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.21 
 
 
644 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.65 
 
 
490 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
756 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  31.01 
 
 
493 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  39.56 
 
 
840 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1387  hypothetical protein  29.33 
 
 
270 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119697  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.83 
 
 
806 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  27.23 
 
 
488 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32 
 
 
522 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  34.04 
 
 
1567 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  31.47 
 
 
514 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  28.24 
 
 
172 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  23.35 
 
 
627 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>