208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0737 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
345 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  47.94 
 
 
337 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  32.64 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  31.28 
 
 
829 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  31.94 
 
 
357 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  31.5 
 
 
699 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.06 
 
 
537 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
345 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  31.86 
 
 
501 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  32.63 
 
 
522 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  32.06 
 
 
495 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  34.42 
 
 
472 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 
510 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 
472 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
340 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 
327 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  32.18 
 
 
306 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  31.03 
 
 
524 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  31.36 
 
 
334 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.78 
 
 
304 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 
503 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.1 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.7 
 
 
505 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25 
 
 
540 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
315 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
535 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
537 aa  89.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.33 
 
 
319 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.28 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.55 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.56 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.56 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  33.45 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.93 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
492 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 
547 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  29.56 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 
545 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.11 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.6 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
310 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 
511 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  26.84 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.49 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.96 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.45 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.95 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  29 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.73 
 
 
707 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  25.45 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.22 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  27.55 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.83 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.33 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.56 
 
 
488 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.41 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.31 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.84 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.37 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.67 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  22.81 
 
 
532 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  26.95 
 
 
550 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.4 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.22 
 
 
562 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.52 
 
 
466 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  25.44 
 
 
527 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
516 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  28.11 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.95 
 
 
536 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  25.87 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
514 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.38 
 
 
523 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.44 
 
 
746 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
1121 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.53 
 
 
444 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
484 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  24.68 
 
 
789 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.12 
 
 
539 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>