72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4281 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  43.68 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  40.49 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  42.28 
 
 		 376 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  37.4 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 348 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  34.88 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  35.25 
 
 		 456 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  39.36 
 
 		 505 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  32.05 
 
 		 472 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30.08 
 
 		 495 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 345 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.96 
 
 		 522 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  31.89 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.11 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.88 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.82 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.75 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.96 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.24 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  26.04 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 644 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.97 
 
 		 618 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  30.63 
 
 		 468 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  21.63 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 503 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.05 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  20.94 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 		 497 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.61 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.4 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.71 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 464 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.27 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 		 472 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 		 517 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  29.19 
 
 		 502 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  24.81 
 
 		 524 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  24.36 
 
 		 533 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 		 1338 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  23.73 
 
 		 713 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.25 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.11 
 
 		 527 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.22 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  24.89 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.07 
 
 		 562 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 		 506 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.46 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.46 
 
 		 505 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.91 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  22.49 
 
 		 349 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  31.3 
 
 		 535 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.25 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>