109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0989 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 
334 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  69.83 
 
 
319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  58.09 
 
 
331 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  43.62 
 
 
343 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  43.92 
 
 
315 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.13 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  43.09 
 
 
472 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  42 
 
 
327 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.14 
 
 
357 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.14 
 
 
356 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.82 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.82 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  43.2 
 
 
598 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.61 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.75 
 
 
352 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.88 
 
 
366 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  44.93 
 
 
379 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  41.69 
 
 
491 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  36.36 
 
 
472 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  37.99 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  35.46 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  31.73 
 
 
400 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  34.78 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  33.14 
 
 
537 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  29.31 
 
 
386 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  31.48 
 
 
456 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  31.67 
 
 
503 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 
471 aa  99.8  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 
471 aa  96.3  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  33.73 
 
 
494 aa  95.9  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.36 
 
 
699 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  32.84 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 
475 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  30.88 
 
 
703 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.86 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.92 
 
 
789 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.25 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.57 
 
 
707 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
1112 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  29.61 
 
 
804 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
1121 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
1121 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.98 
 
 
1121 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  30.94 
 
 
488 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  30.74 
 
 
829 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 
501 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.57 
 
 
810 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.71 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  26.63 
 
 
531 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  26.46 
 
 
525 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 
497 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.16 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  26.15 
 
 
581 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  30.17 
 
 
541 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.12 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  28.96 
 
 
526 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  29.27 
 
 
532 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
540 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.1 
 
 
550 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 
492 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.47 
 
 
488 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  25.51 
 
 
1174 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
1143 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.82 
 
 
350 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  29.77 
 
 
848 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.52 
 
 
523 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
497 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.81 
 
 
541 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.48 
 
 
586 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
572 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.2 
 
 
456 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  30.19 
 
 
517 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.49 
 
 
537 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 
546 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.88 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.85 
 
 
515 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.43 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.84 
 
 
648 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.73 
 
 
562 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
563 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
581 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 
560 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
636 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  25.4 
 
 
546 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.4 
 
 
556 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
551 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
536 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.98 
 
 
547 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
512 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
1195 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>