225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2723 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 345 aa  705    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  51.16 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  47.19 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  42.91 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  39.42 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  40.49 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  35.69 
 
 		 495 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  36.13 
 
 		 472 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  32.75 
 
 		 524 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  32.34 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  31.58 
 
 		 522 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.33 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  34.26 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  29.01 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  28.35 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.6 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.95 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  31.7 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  31.68 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.66 
 
 		 509 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.74 
 
 		 501 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.69 
 
 		 384 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.2 
 
 		 537 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  29.96 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  33.56 
 
 		 550 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  31 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  31.66 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.77 
 
 		 512 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 572 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  27.64 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.61 
 
 		 713 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  31.5 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.15 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  30.26 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.39 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  29.15 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 855 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  29.41 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30.3 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  34.1 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.84 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.14 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.42 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 699 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.18 
 
 		 1338 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.24 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  27.63 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.65 
 
 		 712 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  27.7 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.71 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  28.97 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  28.89 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.28 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 636 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 537 aa  72.8  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  28.88 
 
 		 542 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.96 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.86 
 
 		 577 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  27.48 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  29.28 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.72 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.86 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>