145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03855 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  100 
 
 		 556 aa  1123    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  50.09 
 
 		 563 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  49.1 
 
 		 581 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  47.69 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.43 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.9 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  41.62 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 		 571 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  39.85 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.89 
 
 		 538 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.5 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  37.09 
 
 		 517 aa  269  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.84 
 
 		 546 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  35.82 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  34.75 
 
 		 496 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  34.93 
 
 		 484 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  35.84 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.08 
 
 		 536 aa  223  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  41.67 
 
 		 526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.7 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 636 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.89 
 
 		 550 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  32.4 
 
 		 541 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.94 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.69 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.21 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.55 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  42.24 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.95 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.89 
 
 		 546 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.02 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.09 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.48 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  39.14 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  38.02 
 
 		 586 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  31.11 
 
 		 539 aa  193  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  31.83 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  31.24 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  30.55 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.6 
 
 		 559 aa  161  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.4 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  31.92 
 
 		 591 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.57 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.71 
 
 		 562 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  26.66 
 
 		 590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.98 
 
 		 522 aa  148  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 560 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.31 
 
 		 553 aa  144  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.62 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 		 1338 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.44 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  28.39 
 
 		 746 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 1195 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.52 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 537 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.82 
 
 		 525 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.57 
 
 		 511 aa  120  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 535 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.93 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.13 
 
 		 1585 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.86 
 
 		 797 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.89 
 
 		 1474 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.44 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  27.63 
 
 		 691 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.94 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 472 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  25.25 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  35.57 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.76 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  23.68 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.53 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.06 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.09 
 
 		 855 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.18 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>