143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0739 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 348 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  44.95 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  42.14 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  34.43 
 
 		 456 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  33.22 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  35.26 
 
 		 505 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  34.05 
 
 		 472 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30.96 
 
 		 495 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  34.41 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.77 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 487 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.27 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.54 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.96 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.24 
 
 		 577 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.09 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  24.64 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.41 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.55 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.43 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.34 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.63 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.04 
 
 		 829 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.46 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  29.29 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.71 
 
 		 538 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  28.12 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  23.15 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.82 
 
 		 618 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.94 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.03 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  23.34 
 
 		 1338 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  24.84 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.08 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  27.1 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.7 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.09 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.42 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  26.84 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.65 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.35 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.8 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 		 855 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  24.22 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.57 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  30.56 
 
 		 713 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.37 
 
 		 450 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  21.67 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.29 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 		 571 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  23.61 
 
 		 551 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 		 536 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  21.5 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.84 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  26.21 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  21.27 
 
 		 475 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 537 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  23.02 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.05 
 
 		 546 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  25.44 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 516 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.78 
 
 		 540 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  23.72 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.81 
 
 		 576 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  21.97 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  21.97 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  23.34 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>