200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0193 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 324 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  76.31 
 
 		 330 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  74.26 
 
 		 323 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  43.39 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 		 644 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  39.31 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  39.07 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.67 
 
 		 450 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  31.71 
 
 		 509 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.49 
 
 		 535 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.76 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  30.47 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.2 
 
 		 1186 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.31 
 
 		 533 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.66 
 
 		 444 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.33 
 
 		 679 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  30.13 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  29.88 
 
 		 524 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  31.74 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  30.31 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  30.92 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.61 
 
 		 393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  29.67 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.02 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  33.06 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.04 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.85 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.76 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.13 
 
 		 618 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.82 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.34 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.08 
 
 		 1338 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.05 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  31.17 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  26.65 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 464 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.45 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.3 
 
 		 385 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.07 
 
 		 383 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.67 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.09 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.83 
 
 		 527 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.92 
 
 		 712 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.15 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.17 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  24.37 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.6 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.93 
 
 		 547 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  22.6 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 495 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.77 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.79 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 829 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.73 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  24.84 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.92 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25.94 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.9 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.29 
 
 		 699 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.95 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.69 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.52 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.79 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  29.26 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.35 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 586 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.1 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.47 
 
 		 566 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.34 
 
 		 537 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.6 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.12 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  23.37 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>