143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3531 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
511 aa  1041    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  59.56 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  53.37 
 
 
537 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  52.08 
 
 
534 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  50.2 
 
 
537 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  50 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  49.4 
 
 
540 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  47.67 
 
 
545 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  57.75 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 
512 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  39 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 
636 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  32.27 
 
 
484 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  34.53 
 
 
550 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.33 
 
 
532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.28 
 
 
523 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 
581 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  34.57 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  36.91 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 
519 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.28 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.22 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.42 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  26.53 
 
 
566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.23 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  29.87 
 
 
496 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.39 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.67 
 
 
488 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.08 
 
 
536 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.93 
 
 
538 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.83 
 
 
512 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.55 
 
 
539 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.78 
 
 
541 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
540 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.62 
 
 
562 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  29.21 
 
 
539 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  34.1 
 
 
526 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.79 
 
 
515 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.23 
 
 
547 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  37.45 
 
 
551 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.75 
 
 
1474 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.1 
 
 
556 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 
1195 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.94 
 
 
558 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.43 
 
 
546 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29 
 
 
527 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  30.87 
 
 
541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  29.24 
 
 
560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  30.94 
 
 
586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.67 
 
 
537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.16 
 
 
559 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.35 
 
 
537 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  29.63 
 
 
542 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
543 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 
522 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
504 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.08 
 
 
522 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  30.2 
 
 
522 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
571 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.27 
 
 
522 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.08 
 
 
525 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
521 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 
524 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.95 
 
 
552 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.81 
 
 
546 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.86 
 
 
501 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.42 
 
 
553 aa  97.4  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.05 
 
 
746 aa  93.6  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.49 
 
 
650 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 
472 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  28.72 
 
 
591 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 
797 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
345 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 
691 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.21 
 
 
699 aa  77  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.33 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  23.76 
 
 
1338 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  37.38 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.58 
 
 
537 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.08 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.26 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  25.45 
 
 
590 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 
530 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.13 
 
 
345 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  22.83 
 
 
1585 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  23.33 
 
 
518 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>