170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3237 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  71.17 
 
 		 1221 aa  1005    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1195 aa  2445    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  59.18 
 
 		 521 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.3 
 
 		 810 aa  349  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 		 746 aa  347  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.82 
 
 		 714 aa  339  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  54.73 
 
 		 1026 aa  333  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.24 
 
 		 1607 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.49 
 
 		 1183 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.48 
 
 		 826 aa  328  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.5 
 
 		 1126 aa  327  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.71 
 
 		 805 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.77 
 
 		 540 aa  322  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.59 
 
 		 1507 aa  321  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  50 
 
 		 633 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  51.29 
 
 		 1178 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.98 
 
 		 1292 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  51.06 
 
 		 1848 aa  315  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  52.96 
 
 		 1255 aa  314  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  49.72 
 
 		 920 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  51.8 
 
 		 701 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.55 
 
 		 1130 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.46 
 
 		 1383 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  52.75 
 
 		 2802 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 		 721 aa  304  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  35.99 
 
 		 665 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  47.71 
 
 		 884 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  36.9 
 
 		 530 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.49 
 
 		 408 aa  288  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.29 
 
 		 887 aa  282  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  51.92 
 
 		 1285 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  43.77 
 
 		 640 aa  280  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  49.19 
 
 		 462 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  48.78 
 
 		 791 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  53.12 
 
 		 1176 aa  274  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  47.93 
 
 		 933 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  44.69 
 
 		 485 aa  272  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 504 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  48.05 
 
 		 862 aa  270  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.94 
 
 		 1585 aa  269  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  35.17 
 
 		 518 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 		 518 aa  261  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.72 
 
 		 1176 aa  254  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  34.18 
 
 		 500 aa  248  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.76 
 
 		 664 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  31.18 
 
 		 532 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.09 
 
 		 691 aa  234  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  43.68 
 
 		 3563 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  31.95 
 
 		 536 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.58 
 
 		 562 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  34.37 
 
 		 532 aa  229  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 572 aa  228  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  33.74 
 
 		 522 aa  226  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  49.44 
 
 		 648 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  36.05 
 
 		 522 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  32.12 
 
 		 551 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  42.55 
 
 		 308 aa  212  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.3 
 
 		 474 aa  209  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  40.63 
 
 		 488 aa  208  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  31.5 
 
 		 560 aa  207  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.89 
 
 		 522 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 543 aa  197  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  38.91 
 
 		 492 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  41.4 
 
 		 325 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 		 508 aa  195  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  31.75 
 
 		 503 aa  194  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.87 
 
 		 507 aa  191  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  42.55 
 
 		 288 aa  188  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  39.24 
 
 		 829 aa  188  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.17 
 
 		 520 aa  187  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  34.98 
 
 		 1338 aa  183  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  32.35 
 
 		 525 aa  175  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.61 
 
 		 527 aa  166  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 514 aa  166  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  35.08 
 
 		 536 aa  157  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  35.08 
 
 		 780 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 516 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.46 
 
 		 532 aa  152  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1083 aa  152  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.82 
 
 		 539 aa  146  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 563 aa  144  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 550 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  32.78 
 
 		 519 aa  141  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.55 
 
 		 536 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.55 
 
 		 1474 aa  137  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.31 
 
 		 515 aa  131  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.11 
 
 		 512 aa  128  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  27.06 
 
 		 566 aa  127  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  28.11 
 
 		 541 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 581 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.79 
 
 		 484 aa  126  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  30.71 
 
 		 517 aa  125  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 636 aa  124  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 		 535 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.14 
 
 		 523 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.65 
 
 		 546 aa  123  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  31.32 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.41 
 
 		 538 aa  121  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>