162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1400 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 517 aa  1040    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  59.65 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  44.42 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  40.73 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  46.03 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 516 aa  362  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  41.76 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  42.97 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.22 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.46 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.51 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  38.34 
 
 		 566 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  41.86 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  40.27 
 
 		 492 aa  299  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.77 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.19 
 
 		 538 aa  296  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  37.41 
 
 		 563 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.36 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  36.89 
 
 		 556 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  34.48 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  38.72 
 
 		 542 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  34.51 
 
 		 540 aa  253  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.34 
 
 		 523 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  34.74 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.63 
 
 		 546 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  34.18 
 
 		 550 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.19 
 
 		 541 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.35 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  35.08 
 
 		 532 aa  243  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.86 
 
 		 547 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  47.02 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.56 
 
 		 537 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.87 
 
 		 537 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.62 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 636 aa  226  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  33.02 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  35.32 
 
 		 591 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.22 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.73 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.78 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  29.57 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  32.87 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.66 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 		 522 aa  150  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  31.2 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  27 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.99 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  34.57 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 543 aa  140  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 547 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.48 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  30.26 
 
 		 536 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.31 
 
 		 746 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 		 551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.81 
 
 		 1338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  31.55 
 
 		 525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 		 665 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 1195 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  33.81 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  28.35 
 
 		 503 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  28.67 
 
 		 691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  32.89 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.76 
 
 		 1474 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  31.44 
 
 		 797 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.83 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  28.54 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.03 
 
 		 1585 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 304 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 		 343 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  27.94 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  22.74 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.23 
 
 		 699 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  31.02 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 324 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>