141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3048 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 515 aa  1024    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  42.23 
 
 		 519 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  44.57 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  47 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  55.22 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.79 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  41.41 
 
 		 517 aa  345  8e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  41.15 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  37.79 
 
 		 566 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  41.44 
 
 		 497 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.82 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  42.29 
 
 		 484 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.64 
 
 		 558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.59 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  37.3 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  39.1 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  32.36 
 
 		 571 aa  266  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  43.97 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.12 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  37.63 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  36.81 
 
 		 492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.49 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  41.43 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.15 
 
 		 541 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  42.62 
 
 		 586 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  44.26 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  41.33 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.83 
 
 		 550 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  35.17 
 
 		 590 aa  213  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.16 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  31.39 
 
 		 546 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 636 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.83 
 
 		 537 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.63 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.04 
 
 		 539 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.65 
 
 		 537 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.81 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  38.67 
 
 		 540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.99 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.46 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  33.66 
 
 		 539 aa  173  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  32.93 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  36.88 
 
 		 591 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.25 
 
 		 1338 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  32.27 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 		 1195 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.74 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 543 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.63 
 
 		 530 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  30.99 
 
 		 522 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 504 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  32.83 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 537 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 		 650 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.02 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  31.5 
 
 		 511 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  30.39 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.97 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.87 
 
 		 746 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.59 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.72 
 
 		 1474 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 537 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.59 
 
 		 1585 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  25.31 
 
 		 500 aa  96.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 		 343 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 		 545 aa  94  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  29.18 
 
 		 797 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 691 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.41 
 
 		 522 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.58 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 532 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.86 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  24.84 
 
 		 901 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  25.16 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 699 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.44 
 
 		 829 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  23.14 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>