244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0206 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  53.95 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 		 345 aa  285  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  44.95 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  40.21 
 
 		 456 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  39.8 
 
 		 505 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  33.11 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  34.69 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.78 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  33.45 
 
 		 472 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  31.56 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  34.63 
 
 		 495 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  31.69 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  31.19 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  31.29 
 
 		 522 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  30.55 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  32.76 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  31.39 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  31.02 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.13 
 
 		 510 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  31.83 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  34.09 
 
 		 487 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  33.64 
 
 		 542 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  31.46 
 
 		 497 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.35 
 
 		 713 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 341 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.85 
 
 		 537 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 699 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 517 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 644 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 		 503 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  29.9 
 
 		 338 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.96 
 
 		 562 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.72 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 		 560 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  29.97 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 512 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.43 
 
 		 855 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  31.41 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.89 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  32.07 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.87 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.89 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.9 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.49 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  29.8 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  29.47 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.03 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 829 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.77 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.22 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.16 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.03 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  30.19 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.44 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28.53 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  27.67 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.55 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.68 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  27.19 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 522 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.19 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.57 
 
 		 527 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 496 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  32.35 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.46 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  28.82 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.56 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.87 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 543 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.88 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  34.02 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.1 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>