103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1661 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  100 
 
 		 901 aa  1834    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.96 
 
 		 1338 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  38.89 
 
 		 530 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 		 518 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.07 
 
 		 1585 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  33.9 
 
 		 500 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  37.23 
 
 		 518 aa  180  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  30.55 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  30.35 
 
 		 746 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 		 1195 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 521 aa  118  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.5 
 
 		 522 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 504 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 		 522 aa  107  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  28.91 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  29.97 
 
 		 691 aa  102  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.14 
 
 		 522 aa  98.6  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  28.9 
 
 		 503 aa  95.9  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 543 aa  95.5  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 572 aa  93.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.83 
 
 		 525 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 537 aa  92.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 537 aa  90.9  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 		 497 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 532 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.94 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.69 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  24.83 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.12 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  26 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.82 
 
 		 712 aa  81.6  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.87 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.73 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 512 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.42 
 
 		 538 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.84 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.64 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 535 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.05 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.09 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.79 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  30.43 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  32.86 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 517 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.22 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.97 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.42 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.48 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  31.01 
 
 		 556 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  33.33 
 
 		 542 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.03 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  32.88 
 
 		 541 aa  63.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.72 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  31.54 
 
 		 496 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.48 
 
 		 558 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.41 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.76 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 571 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  31.25 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 		 636 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  23.46 
 
 		 539 aa  57.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 		 540 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.03 
 
 		 1474 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.78 
 
 		 667 aa  55.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  27.15 
 
 		 1172 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.76 
 
 		 547 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  33.7 
 
 		 591 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  31.69 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.09 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.55 
 
 		 355 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.55 
 
 		 356 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 619 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.66 
 
 		 355 aa  52  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.89 
 
 		 552 aa  51.2  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  24.6 
 
 		 546 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.1 
 
 		 341 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  31.34 
 
 		 472 aa  50.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.54 
 
 		 352 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 		 522 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  30.87 
 
 		 1065 aa  47  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.93 
 
 		 1146 aa  47  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  22.99 
 
 		 1059 aa  45.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  22.99 
 
 		 1059 aa  45.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  31.58 
 
 		 495 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  22.67 
 
 		 650 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>