140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2028 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 498 aa  1035    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  40.73 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  40.29 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  37.18 
 
 		 497 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  38.68 
 
 		 519 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  35.32 
 
 		 484 aa  283  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.82 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 563 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  35.74 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  33.14 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  33.6 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 581 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.2 
 
 		 515 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  31.66 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  32.4 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  32.94 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.71 
 
 		 577 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  31.22 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.7 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 636 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  29.9 
 
 		 556 aa  220  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.32 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.85 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.35 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.26 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.7 
 
 		 546 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 512 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.22 
 
 		 537 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 571 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.04 
 
 		 537 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.33 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 		 546 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  29.39 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.79 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  29.17 
 
 		 539 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.91 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  28.75 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.79 
 
 		 558 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  29.49 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.41 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.06 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  26.97 
 
 		 591 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 537 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  29.71 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  30.34 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.34 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.95 
 
 		 536 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  30.14 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  25.9 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 		 545 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.31 
 
 		 525 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  27.42 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.67 
 
 		 562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.96 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  24.39 
 
 		 560 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.64 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 551 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  25.84 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 1195 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 1338 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 524 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.13 
 
 		 501 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.64 
 
 		 746 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  43.93 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  26.55 
 
 		 901 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.67 
 
 		 1585 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 		 699 aa  80.1  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 		 691 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.7 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.41 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  24.5 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.32 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.91 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  21.86 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  22.35 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  23.18 
 
 		 1474 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>