218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0650 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 495 aa  1028    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  52.87 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  31.91 
 
 		 524 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  33.26 
 
 		 522 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  35.69 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  37.07 
 
 		 306 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  34.63 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  33.88 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  32.12 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  33.09 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.35 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.93 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  28.53 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 535 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.23 
 
 		 519 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.83 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.5 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.65 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 537 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.2 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.93 
 
 		 577 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 523 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.21 
 
 		 315 aa  97.1  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.92 
 
 		 334 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.57 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.3 
 
 		 566 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.79 
 
 		 546 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 543 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 546 aa  93.2  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  23.23 
 
 		 563 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.53 
 
 		 550 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 325 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 304 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.12 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 636 aa  90.1  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 		 699 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  23.38 
 
 		 512 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 540 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.43 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.6 
 
 		 538 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 581 aa  86.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  23.84 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 829 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  27.64 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  23.19 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.45 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.03 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.15 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  26.89 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.01 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.69 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.74 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.8 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.76 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.32 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.07 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.34 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.37 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  28.63 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.24 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.7 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.79 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.22 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>