196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1729 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
472 aa  958    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  39.89 
 
 
456 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.8 
 
 
707 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
471 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.41 
 
 
810 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 
471 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  40.55 
 
 
315 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 
1112 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
1143 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
476 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  28.88 
 
 
1121 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
475 aa  190  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 
1121 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.44 
 
 
789 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
1121 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  28.42 
 
 
804 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  27.65 
 
 
494 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  29.02 
 
 
1174 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  37.22 
 
 
331 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 
488 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.56 
 
 
343 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27.58 
 
 
703 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.72 
 
 
848 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.83 
 
 
319 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.12 
 
 
341 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.71 
 
 
366 aa  160  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.42 
 
 
327 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.84 
 
 
357 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.56 
 
 
355 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.94 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.56 
 
 
356 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.25 
 
 
355 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.05 
 
 
346 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  30.93 
 
 
531 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.67 
 
 
334 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  34.12 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.83 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32.28 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  30.81 
 
 
357 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.99 
 
 
829 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  30.13 
 
 
598 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  29.91 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.56 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
345 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  27.51 
 
 
581 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.15 
 
 
503 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 
699 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 
524 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 
510 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  27.67 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 
501 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  27.78 
 
 
380 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  29.45 
 
 
320 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.35 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.04 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  27.87 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.23 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.26 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  23.06 
 
 
519 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 
572 aa  76.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
304 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.32 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.71 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.3 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 
563 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.56 
 
 
560 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.28 
 
 
550 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  22.51 
 
 
542 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  21.59 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.31 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  30.74 
 
 
530 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.36 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.93 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.91 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
636 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.15 
 
 
532 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 
581 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
323 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.9 
 
 
367 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.03 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.54 
 
 
552 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.28 
 
 
324 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
504 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
644 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>