133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0664 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  68.27 
 
 		 471 aa  672    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  93.21 
 
 		 475 aa  919    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  67.3 
 
 		 471 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 476 aa  984    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  61.16 
 
 		 707 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  49.13 
 
 		 789 aa  458  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  46.73 
 
 		 804 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.72 
 
 		 810 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  49.34 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  49.02 
 
 		 703 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  46.36 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  45.81 
 
 		 1121 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 		 1121 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 		 1121 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 1112 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 1143 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  38.64 
 
 		 848 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  40.16 
 
 		 1174 aa  346  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  30.82 
 
 		 531 aa  209  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.19 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  30.77 
 
 		 581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  31.75 
 
 		 315 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.21 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.7 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.33 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.92 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.58 
 
 		 355 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.98 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.76 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.16 
 
 		 598 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  30.36 
 
 		 331 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.43 
 
 		 356 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.67 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.95 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.2 
 
 		 334 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.2 
 
 		 319 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.82 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.58 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.72 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  27.24 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.71 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.92 
 
 		 537 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  23.8 
 
 		 323 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.03 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.75 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.16 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.47 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.04 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 345 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  24.06 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.51 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 		 522 aa  57  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  25.93 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.37 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.18 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.9 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  22.39 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.91 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.18 
 
 		 829 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 636 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.98 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31.58 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 464 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.51 
 
 		 562 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  27.27 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  23.86 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.9 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  25.51 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  22.6 
 
 		 572 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.4 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 644 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  29.22 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 537 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.52 
 
 		 497 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  26.2 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 310 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 560 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  24.39 
 
 		 539 aa  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  25.93 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  22.49 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>