108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2047 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  46.19 
 
 		 1174 aa  998    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  78.21 
 
 		 1121 aa  1831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  78.21 
 
 		 1121 aa  1830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  78.12 
 
 		 1121 aa  1825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1112 aa  2268    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  67.47 
 
 		 1143 aa  1498    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  41.58 
 
 		 848 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  42.25 
 
 		 804 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  44.86 
 
 		 789 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.57 
 
 		 707 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  44.18 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42 
 
 		 810 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  45.41 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 476 aa  379  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  43.87 
 
 		 488 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  43.59 
 
 		 703 aa  352  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  37.55 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 		 472 aa  203  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  31.98 
 
 		 531 aa  189  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  39.39 
 
 		 249 aa  178  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  42.15 
 
 		 251 aa  163  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  39.01 
 
 		 250 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  37.67 
 
 		 250 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  32.63 
 
 		 581 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  35.83 
 
 		 247 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  35.11 
 
 		 247 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  32.55 
 
 		 258 aa  131  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  34.38 
 
 		 258 aa  126  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  35.64 
 
 		 250 aa  121  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  35.11 
 
 		 250 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 		 456 aa  117  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 331 aa  108  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 		 357 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.35 
 
 		 343 aa  96.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.88 
 
 		 319 aa  94.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.42 
 
 		 355 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.82 
 
 		 356 aa  92.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.74 
 
 		 327 aa  92  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.51 
 
 		 355 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.13 
 
 		 352 aa  90.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.53 
 
 		 357 aa  88.6  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 341 aa  88.2  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  28.09 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.15 
 
 		 346 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.43 
 
 		 341 aa  84  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.78 
 
 		 334 aa  77.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.13 
 
 		 829 aa  76.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  25.97 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.58 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  26.06 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.85 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  27.53 
 
 		 3320 aa  64.3  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 480 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.95 
 
 		 366 aa  62  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  21.95 
 
 		 4761 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  24.91 
 
 		 598 aa  61.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.86 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.48 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 345 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.57 
 
 		 739 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 		 522 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 		 524 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  22.51 
 
 		 487 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.46 
 
 		 1013 aa  52.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 484 aa  52.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 537 aa  52.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  33.68 
 
 		 531 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 323 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  46.97 
 
 		 926 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 644 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  25.45 
 
 		 1035 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 519 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.93 
 
 		 304 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.22 
 
 		 379 aa  50.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  23.64 
 
 		 865 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 636 aa  50.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 497 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  22.27 
 
 		 4357 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.46 
 
 		 497 aa  48.9  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  29.33 
 
 		 2205 aa  48.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  24.72 
 
 		 741 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  24.72 
 
 		 741 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0850  hypothetical protein  34.83 
 
 		 428 aa  48.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  24.72 
 
 		 741 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25.28 
 
 		 501 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.14 
 
 		 553 aa  46.2  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  22.89 
 
 		 525 aa  46.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  25.82 
 
 		 429 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.84 
 
 		 505 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  26.88 
 
 		 380 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  23.26 
 
 		 846 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  22.91 
 
 		 236 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  25.22 
 
 		 307 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.97 
 
 		 598 aa  45.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>